现为公安九课少校的草薙素子，按照课长荒卷二天，陈源带着苏云和陶共下楼的时候。在楼梯！烈毛引四只变异的怪物，不过这次是不是巨蟒，也不是野狗，而是两只巨大的蝙蝠，倒挂在楼梯上方的角落里，那个头，每一只起码都有两三斤重，倒挂在那个角落里被陶艺无意间曹见，顿时吓得两腿一软跌倒在楼梯上。大辅的指示外出调查运输机被神秘并机的事件。结果途中遭到巴特率领的武装分子的袭击。与此同时，遍布全国的姣通管制系统也意外瘫痪。一切源于前七八联合部队的长官曾我和哉，他因制造难民虐杀事件遭到国家指控，而他的下属坚信这一切都是国家阴谋。曾我不甘被污，因此试图通过网络揭露大国的丑行。素子在调查过程中渐渐了解真相，而她也朝着组建自己的部队迈出重要的一步…… 本片为攻壳机动队前传“ARISE”的第二部。
