《恶魔的谜语》故事舞台设定在一个名为“10年黑组”的全住宿制女子高中的班级，这个不等刚刚撞在车厢上的两大汉回过气来，陈源一掌一个，同时斩在他们的颈动脉上，于是两人眼白向上一翻，不分先后地倒在车后面。其中一个。人的右手还在捂着腰，另一个人的双手还在捂着鼻子，指缝间尽是湿漉漉的鼻血。班级里的12名学生都是由暗杀者构成的，她们全都瞄准了她们的同学——一之濑晴的姓命。即使她的姓命被众多人觊觎，一之濑晴依然发誓一定要活着毕业。另一方面，同样也是准备夺取一之濑晴姓命的暗杀者——转校生东兔角却在一次次接近对方时，渐渐地被晴所吸引。在同学们对晴展开攻击之时，兔角则以保护者的姿态与她们开始了战斗。
